MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 38221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	ATG	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
2	NC_014471	CTG	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662446
3	NC_014471	AT	3	6	804	809	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
4	NC_014471	AG	3	6	818	823	50 %	0 %	50 %	0 %	305662446
5	NC_014471	TA	3	6	839	844	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
6	NC_014471	TGA	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
7	NC_014471	AG	3	6	863	868	50 %	0 %	50 %	0 %	305662446
8	NC_014471	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662446
9	NC_014471	TTA	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662446
10	NC_014471	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
11	NC_014471	TA	3	6	1040	1045	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
12	NC_014471	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
13	NC_014471	ACC	2	6	1064	1069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662446
14	NC_014471	TAC	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
15	NC_014471	AGA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
16	NC_014471	AGG	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
17	NC_014471	TTG	2	6	1191	1196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
18	NC_014471	CTT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662446
19	NC_014471	TA	3	6	1245	1250	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
20	NC_014471	GTG	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662446
21	NC_014471	AAT	2	6	1294	1299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
22	NC_014471	TTG	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
23	NC_014471	AGT	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
24	NC_014471	GGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
25	NC_014471	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
26	NC_014471	ATA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
27	NC_014471	GCA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
28	NC_014471	GCA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
29	NC_014471	AG	3	6	1496	1501	50 %	0 %	50 %	0 %	305662446
30	NC_014471	AG	3	6	1555	1560	50 %	0 %	50 %	0 %	305662446
31	NC_014471	GTT	2	6	1574	1579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
32	NC_014471	TA	3	6	1593	1598	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
33	NC_014471	TAC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
34	NC_014471	GGT	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662446
35	NC_014471	GAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
36	NC_014471	TA	3	6	1728	1733	50 %	50 %	0 %	0 %	305662446
37	NC_014471	AGA	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
38	NC_014471	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
39	NC_014471	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
40	NC_014471	AGG	2	6	1920	1925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
41	NC_014471	ACT	2	6	1942	1947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
42	NC_014471	A	6	6	1985	1990	100 %	0 %	0 %	0 %	305662447
43	NC_014471	TGT	3	9	2012	2020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662447
44	NC_014471	ATA	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662447
45	NC_014471	ATT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662447
46	NC_014471	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662447
47	NC_014471	ATC	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662447
48	NC_014471	TATC	2	8	2384	2391	25 %	50 %	0 %	25 %	305662447
49	NC_014471	AAG	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662447
50	NC_014471	ATG	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662447
51	NC_014471	AG	3	6	2534	2539	50 %	0 %	50 %	0 %	305662447
52	NC_014471	TAGA	2	8	2546	2553	50 %	25 %	25 %	0 %	305662447
53	NC_014471	CTT	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
54	NC_014471	TATC	2	8	2579	2586	25 %	50 %	0 %	25 %	305662448
55	NC_014471	CTAG	2	8	2599	2606	25 %	25 %	25 %	25 %	305662448
56	NC_014471	ATCT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	305662448
57	NC_014471	CAT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
58	NC_014471	CAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662448
59	NC_014471	TCTTCC	2	12	2772	2783	0 %	50 %	0 %	50 %	305662448
60	NC_014471	TCT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
61	NC_014471	AC	3	6	2827	2832	50 %	0 %	0 %	50 %	305662448
62	NC_014471	ATTT	2	8	2880	2887	25 %	75 %	0 %	0 %	305662448
63	NC_014471	TAA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662448
64	NC_014471	AT	3	6	2987	2992	50 %	50 %	0 %	0 %	305662448
65	NC_014471	ATCC	2	8	3032	3039	25 %	25 %	0 %	50 %	305662448
66	NC_014471	CCAT	2	8	3132	3139	25 %	25 %	0 %	50 %	305662448
67	NC_014471	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662448
68	NC_014471	ATT	2	6	3255	3260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662448
69	NC_014471	TGT	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662448
70	NC_014471	TCT	2	6	3334	3339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
71	NC_014471	TCC	2	6	3342	3347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
72	NC_014471	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	305662448
73	NC_014471	GTAT	2	8	3379	3386	25 %	50 %	25 %	0 %	305662448
74	NC_014471	AT	3	6	3385	3390	50 %	50 %	0 %	0 %	305662448
75	NC_014471	CCA	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662448
76	NC_014471	TGT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662448
77	NC_014471	CTCTC	2	10	3477	3486	0 %	40 %	0 %	60 %	305662448
78	NC_014471	CTC	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
79	NC_014471	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
80	NC_014471	TAGA	2	8	3542	3549	50 %	25 %	25 %	0 %	305662448
81	NC_014471	GCA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662448
82	NC_014471	CAC	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662448
83	NC_014471	CTG	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662448
84	NC_014471	GAA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662448
85	NC_014471	CTA	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
86	NC_014471	ATT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662448
87	NC_014471	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
88	NC_014471	TCC	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
89	NC_014471	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662449
90	NC_014471	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662449
91	NC_014471	A	6	6	4017	4022	100 %	0 %	0 %	0 %	305662449
92	NC_014471	ATG	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
93	NC_014471	TAG	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
94	NC_014471	TAA	2	6	4193	4198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662449
95	NC_014471	GA	3	6	4246	4251	50 %	0 %	50 %	0 %	305662449
96	NC_014471	TGA	2	6	4260	4265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
97	NC_014471	TCA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662449
98	NC_014471	ATA	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662450
99	NC_014471	AGA	2	6	4526	4531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
100	NC_014471	GAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
101	NC_014471	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
102	NC_014471	A	6	6	4615	4620	100 %	0 %	0 %	0 %	305662450
103	NC_014471	TAAAT	2	10	4679	4688	60 %	40 %	0 %	0 %	305662450
104	NC_014471	GCAG	2	8	4691	4698	25 %	0 %	50 %	25 %	305662450
105	NC_014471	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662450
106	NC_014471	TCA	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662450
107	NC_014471	TAA	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662450
108	NC_014471	GA	3	6	4915	4920	50 %	0 %	50 %	0 %	305662451
109	NC_014471	TTG	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662451
110	NC_014471	TG	3	6	5009	5014	0 %	50 %	50 %	0 %	305662451
111	NC_014471	GCA	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662451
112	NC_014471	TA	3	6	5063	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	305662451
113	NC_014471	GAATG	2	10	5074	5083	40 %	20 %	40 %	0 %	305662451
114	NC_014471	T	6	6	5084	5089	0 %	100 %	0 %	0 %	305662451
115	NC_014471	AT	3	6	5141	5146	50 %	50 %	0 %	0 %	305662451
116	NC_014471	TAC	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
117	NC_014471	TAT	2	6	5222	5227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662451
118	NC_014471	CTA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
119	NC_014471	TAC	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
120	NC_014471	CATT	2	8	5389	5396	25 %	50 %	0 %	25 %	305662451
121	NC_014471	TC	3	6	5401	5406	0 %	50 %	0 %	50 %	305662451
122	NC_014471	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662451
123	NC_014471	T	6	6	5482	5487	0 %	100 %	0 %	0 %	305662451
124	NC_014471	AT	3	6	5512	5517	50 %	50 %	0 %	0 %	305662451
125	NC_014471	AT	4	8	5544	5551	50 %	50 %	0 %	0 %	305662451
126	NC_014471	AT	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	305662451
127	NC_014471	GAT	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662451
128	NC_014471	GGTA	2	8	5703	5710	25 %	25 %	50 %	0 %	305662451
129	NC_014471	TGC	2	6	5715	5720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662451
130	NC_014471	A	6	6	5728	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	305662451
131	NC_014471	AT	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	305662452
132	NC_014471	TTA	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662452
133	NC_014471	TAT	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662452
134	NC_014471	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
135	NC_014471	TAA	2	6	5939	5944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
136	NC_014471	GGA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662452
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